Ez kicsit bonyolultabb. Flynn több játékprogram tervezője volt, köztük a Lightcycles nevű cuccé is. A játékokat az ENCOM központi memória egységében tárolták, ami egy hacker támadás következtében öntudatára ébredt. A központi memória által kialakított programvilág azokra a játékokra épül, amelyeket Flynn tervezett, ezért is van az, hogy Flynn-nek és társainak azokat a játékokat kell legyőzniük a történet során, hogy közelebb jussanak a központi memóriához. Vagyis Flynn a programok tervezője, és karakterek kitalálója, de a központi memória ruházta fel őket önálló akarattal.